Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gria2P23819 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms