Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk1P22518 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clk1P22518 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clk1P22518 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Clk1P22518 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk1P22518 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk1P22518 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk1P22518 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk1P22518 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk1P22518 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk1P22518 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk1P22518 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Clk1P22518 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Clk1P22518 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms