Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pou3f1P21952 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pou3f1P21952 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms