Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a2P20490 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms