Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a1P19437 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a1P19437 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms