Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NelfeP19426 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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