Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18529 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18529 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
P18529 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
P18529 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms