Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gata1P17679 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gata1P17679 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms