Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gabra6P16305 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gabra6P16305 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gabra6P16305 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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