Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Irf1P15314 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Irf1P15314 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Irf1P15314 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Irf1P15314 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Irf1P15314 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Irf1P15314 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Irf1P15314 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Irf1P15314 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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