Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scd1P13516 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms