Protein–RNA interactions for Protein: P12979

Myog, Myogenin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyogP12979 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyogP12979 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MyogP12979 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyogP12979 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MyogP12979 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MyogP12979 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyogP12979 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyogP12979 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyogP12979 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms