Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnmt3cP0DOY1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms