Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxa9P09631 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms