Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxa4P06798 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxa4P06798 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms