Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P06320 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P06320 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P06320 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P06320 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P06320 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P06320 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P06320 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P06320 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P06320 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P06320 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06320 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06320 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P06320 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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