Protein–RNA interactions for Protein: P03911

Mtnd4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd4P03911 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mtnd4P03911 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mtnd4P03911 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms