Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl20O89093 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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