Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tom1O88746 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tom1O88746 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tom1O88746 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms