Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CaskO70589 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CaskO70589 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CaskO70589 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CaskO70589 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CaskO70589 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms