Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mid1O70583 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mid1O70583 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms