Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd70O55237 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd70O55237 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms