Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rad51dO55230 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rad51dO55230 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rad51dO55230 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rad51dO55230 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad51dO55230 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rad51dO55230 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad51dO55230 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad51dO55230 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rad51dO55230 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms