Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sap18O55128 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms