Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacna1bO55017 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cacna1bO55017 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms