Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdk5r2O35926 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdk5r2O35926 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms