Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cited2O35740 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cited2O35740 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms