Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn6O35646 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn6O35646 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn6O35646 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms