Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Scarb2O35114 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Scarb2O35114 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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