Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ArxO35085 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ArxO35085 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ArxO35085 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ArxO35085 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ArxO35085 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ArxO35085 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ArxO35085 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ArxO35085 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ArxO35085 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ArxO35085 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ArxO35085 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms