Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
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Hps1O08983 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hps1O08983 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Hps1O08983 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Hps1O08983 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hps1O08983 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps1O08983 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps1O08983 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps1O08983 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hps1O08983 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps1O08983 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps1O08983 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hps1O08983 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Hps1O08983 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Hps1O08983 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps1O08983 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hps1O08983 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps1O08983 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps1O08983 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps1O08983 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps1O08983 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps1O08983 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps1O08983 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps1O08983 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hps1O08983 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hps1O08983 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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