Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Efna5O08543 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Efna5O08543 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms