Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Alkal1J3QPP8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkal1J3QPP8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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