Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20795J3QP49 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms