Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm20873J3QMQ9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms