Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20830J3KML6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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