Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Taf4bG5E8Z2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms