Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nccrp1G3X9C2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nccrp1G3X9C2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms