Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd5G3UW60 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd5G3UW60 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms