Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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