Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Srp72F8VQC1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Srp72F8VQC1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp72F8VQC1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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