Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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