Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cald1E9QA15 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms