Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp17lbE9Q9U0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp17lbE9Q9U0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp17lbE9Q9U0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp17lbE9Q9U0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp17lbE9Q9U0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp17lbE9Q9U0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms