Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
6030445D17RikE9Q8F9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms