Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp31E9Q6Y8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp31E9Q6Y8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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