Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp558E9Q1J0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp558E9Q1J0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms