Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdr1E9Q0B4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdr1E9Q0B4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms