Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm9008E9PVG0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm9008E9PVG0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms