Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc62E9PVD1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc62E9PVD1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms